歯科医院での接遇マナーについて質問させていただきます。

kougenreishokuさん

「医療関係の接遇マナーの専門知識」は特にないので、回答資格はないかも知れませんが……。

質問者様が疑問に感じておられるのは、恐らく「対応のし方」ではなく、「言葉遣い」、敬語が可怪しいということですね。
厳密に言えば、そもそも患者（外部の人）に向かって身内の医師を「先生」と呼称すること自体ビジネスマナーに悖っていると言えます。でも現実には「先生」と呼ぶことが当たり前になっている……そういう点では確かに「医療関係の職場というのは、一般の会社での常識とは少し違う」と言えるのかも知れません。医療関係と政治家の事務所でしょうかね（笑）。「先生」を使うと、どうしてもその後を尊敬語にしたくなってしまうのが人情です。本当はその「先生」は身内なのですから、謙譲語にすべきなのですよね。

一般の会社ですべきビジネスマナーを守るならば、

>>「先生にお聞きしてきますので、少々お待ちください。」（『お聞きする』という尊敬語が間違い）
は、
「担当医師に尋いて参りますので、少々お待ち下さい」、

>>「最後に先生に診ていただきますので、少々お待ちください。」（『診ていただく』という尊敬語が間違い）
は、
「最後に担当医師が診ますので、少々お待ち下さい」

でしょうね。後者の「診ます」は、一般の会社なら「拝見します」でしょうが、それこそ、医師がそこまで謙るのもどうか、という微妙な線でしょう。他の方もおっしゃっている通り、患者に不安感を与えない為に自信を持った感じを演出する必要もあるでしょうから（笑）。（話は逸れますが、最後に診察があるのは当然と言うか、患者はそれこそが本命で来ているのでしょうから、そこまでに受けたスケーリングを不安に思うなどということはありませんよね）

>>「院長に確認して参りますので、

という言い方は正しいです。

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基本院長先生しかいらっしゃらないのなら、上記例文の「担当医師」は「院長」と言い換えて下さい。
そもそも外部の人に対して「先生」と言うこと自体がいけない、というのは上記の通りです。
例に挙げられた受け答えがキャンセルを受けたときに限る、となると、確かにそれは接遇の範疇に入る問題かも知れませんね。キャンセルの連絡であっても、そこで対応が邪険になるのでは、接遇面で最低です。