新世紀エヴァンゲリオンについての質問です。

yaruna_makerukaさん

ＧＡＩＮＡＸ総監修ビジュアル・ガイドブック エヴァンゲリオン・クロニクルの
説明ですが、これが一番わかりやすいと思うので引用します。
（公式見解に一番近い説明だと思います。）

ＧＡＩＮＡＸ総監修ビジュアル・ガイドブック
エヴァンゲリオン分冊百科
エヴァンゲリオン・クロニクル１１
用語辞典より引用

人類補完計画

「Ｅ計画」「アダム計画」と並び、
碇ゲンドウが遂行にあたっている計画のひとつ。
ＮＥＲＶの上位機関にあたる人類補完委員会の指導のもと、
使徒殲滅と重ねる形で進められている。
ＮＥＲＶにおけるすべての任務の中で最も重要なものとされ、
その内容は人々の個体生命の形を消し去り、
「出来損ないの群体として行き詰った人類を完全な単体生物へ人工進化させる」
ものだと葛城ミサトは語っていた。
サードインパクトはこの計画遂行の過程（もしくは人類補完計画の一端）で発生している。
計画はゼーレと碇ゲンドウが共に目指してきたものではあったが、
互いに計画内容や方法が異なる部分もあったようで、
最終的に両者は決別している。
ゼーレの当初の計画では、ＥＶＡシリーズによりリリスの卵である黒き月を掘り起こしたのち、
ロンギヌスの槍を用い、リリスを依代に行う予定であったようだが、
第１５使徒アラエル戦において槍が失われてしまったため、
予定は変更され”リリスの分身”であるＥＶＡ初号機が使用され人類の補完が開始される。
一方、ゲンドウが想定していた計画は、その手にアダムの肉体を宿し、
綾波レイと融合することにより「アダムとリリスの禁じられた融合」による人類の補完を行い、
「人類の心の隙間を埋める」というものであったようだが詳細は不明。
ただ、碇ユイと再び逢うための手段と考えていたことは確かであろう。



ここからは私の補足です。

地球に知的生命が発生する以前、
宇宙のどこかに発生した知的生命体体（本編の中では『神』と呼ばれている）が
他の恒星系にも知的生命が発生するように生命の種を蒔きました。
それは、一つの惑星に一つずつ、漂着するはずでしたが、
地球には二つの種が漂着してしまいました。
一つは第一使徒アダム、もう一つは第二使徒リリスです。
第一使徒アダムより生まれた使徒たちは、単体で力を持つものたちです。
第二使使徒リリスより生まれた使徒はリリン、つまりヒト、
人類で、これは郡体で知恵（科学）を持つものたちです。
人類は知恵の力（科学の力）によって、生命の謎を解き明かし、
第一使徒たちに匹敵する力を手に入れようとしていました。
すると、休眠状態にあった第一使徒アダムとアダムから生まれた使徒たちが活動を再開。
人類を滅ぼそうとします。
死海文書により人類の起源を知るゼーレは、
人類が本来、守るべき領分を越えたがゆえに神が罰を与え、
人類を滅ぼそうとしているのだと考えました。
滅びから人類を救う方法として、人類補完計画が考え出されました。
このセリフから考えると
キール「始まりと終わりは同じところにある。よい。全てはこれでよい。」
ゼーレの目的は、人類をリセットして、
人類を、第２使途リリスが地球に漂着した時点に戻すことで、
神に対し贖罪し、神の怒りを静めようとしていたのではないでしょうか？
ゼーレが神に対し贖罪することを考えていたのに対し、
ゲンドウは、アダム（力）とリリス（知恵）を融合させることで
神が想定していた以上の力を得て、神を超えることを望みました。
ゲンドウはエヴァンゲリオン初号機に溶け込んでしまった妻ユイと
再開することを望んでいたので、ユイが望むような形での
人類補完をする必要があったという、個人的な事情もあります。


補完計画の結果について記述します。

ゼーレと日本政府の妨害を、跳ね除け、ミサトが命がけで、
シンジをエヴァンゲリオン初号機に乗せたために、
ゼーレの思うとおりに、事態が運ばなくなりました。

ゲンドウの補完計画は、最終段階で、綾波レイがゲンドウに背き、
人類の未来を決める役割を、シンジに託したため、失敗。
「アダムとリリスの禁じられた融合」によって得られる「神を凌駕する力」は
シンジの物となります。

「ゼーレの儀式」、および、「アダムとリリスの禁じられた融合」によって
サードインパクトが発生。
アンチＡＴフィールドが発生し、人類は液状になります。
（エヴァ世界では人類はＬＣＬという液状のものでできており、
ＡＴフィールドという壁で形が保たれています。
アンチＡＴフィールドとはＡＴフィールドを消去するもので、
これにより、ＡＴフィールドを失った人間は液状となります。）

そして、すべての人間が一つになった中で、
「神を凌駕する力」を持ったシンジが、一人の人間として生きていくことを決断。
ＡＴフィールドを再発生させ、形を取り戻します。
ここで、ゼーレの補完計画は完全に失敗しました。

人類の母であるリリス（＝綾波レイ）によると、他の人間たちも、
自分の形をイメージして、形を取り戻すようです。