大分～熊本旅行を計画してます。

noiincidentさん

熊本県人ですが･･･、その行程は無謀かと思います。（無謀というか、移動だけの旅になる可能性高いです。）
１日目は高速使って、大分に入られるのをお薦めします。
現在の行程であれば、約半日は移動に費やす形になります。
（高速代は浮きますが、時間ロスや疲労を考えると対価価値ないような気がします。）

高速を使えば、高崎山・アメリカンサファリ観れると思います。
大分ベイプレスも行きましたが、正直観覧車があるジャスコのショッピングセンターという感じでわざわざ行くほどでもないと思います。（期待して行ったんですがねー･･･）

ベイプレスは大分市内でも若干外れにあるので正直大分市内で観光が他にないのであれば時間ロスが大きいと思います。
（ショッピングセンターなら、熊本にあるイオンモールクレアが規模は大きいです。車で１０分程行けばサントリー工場があります。）

大分から熊本への移動であれば、５７号線よりもヤマナミが便利です。（ベイプレスだと５７号線）
ヤマナミを使うと途中、湯布院ありますし、少し道を外れれば黒川等もあります。
黒川や小田温泉等は少し高いので阿蘇で安めに泊まるのであれば、阿蘇の内牧・赤水とかがいいと思います。

内牧にある「阿蘇ホテル」では体験ものができる旅行プランもあるようです。
阿蘇ホテル→http://www.asohotel.jp/plan/taiken.php
また、体験ができる場所でも宿泊できるようです。
阿蘇ゆたっと村→ http://www.yutatto-aso.org/

３日目ですが、阿蘇であればカドリーや阿蘇火口に行く手もあります。
また、見学や実地体験なら、体験ものであれば上記以外には阿蘇ファームランド・西原村の阿蘇ミルク牧場
見学であれば、サントリー工場もあります。
但し、すべて予約が必要です。（サントリーは予約無しでも受け付けてくれる場合多いです）

もしお買い物するのであれば、サントリー工場とセットであれば、イオンモールクレア。（旧ダイヤモンドシティクレア）
クレアも国道５７号線から１０分程度のところにあります。

国道５７号線利用であれば、通り沿いから５分程度でユメタウン光の森が他にあります。
ユメタウンは大波止にある夢彩都と同じ会社なので作りは同じ感じです。(夢彩都は食料品など若干高級感ありますが、ユメタウンはそこまで高級感ありません。）

本格的な買い物がしたい場合は鶴屋百貨店がある市内中心部になります。