現在小学5年の男の子の父です。今年の春から子供の体の変化（声変わり･髭・陰毛）...

ninja_5_ninjaさん

まあ，このくらいの年頃の男の子は，こういった性的なものに興味が出てきて，部屋にエロ本を隠し持つのはよくあることです。まして，ロリコン系なら自分と同じくらいの年頃の子が出ているかもしれず，なお興味があるでしょう。

お気持ちは分かりますが，あまり深刻にならずに「掃除していたら（片付けしていたら）エロ本が出てきたよ」などと言って「エロ本を所持していることはちゃんと知っている」と伝えましょう。（くれぐれも，疑って調べたら出てきたなんて言うと，プライバシーの侵害ですから，親子の信頼関係が崩れます。また，今後そんな家宅捜索のようなことを絶対にしちゃいけません。）

また，性的な興味を持つことは自然なことだが，その欲望に任せて女性の心身を傷つけるようなことはしちゃいけないことを，具体的に教えてあげましょう。多分お子さんは，性交やその結果に妊娠すうことなどももう知っていると思います。あるいは，知らないのだとしたら，ちゃんと教えてあげましょう。いずれにしても，性は生命を受け継いでいくための大切なものなのだということをしっかり教えましょう。
親御さんが性に対して隠したり，汚らしく見たりすると，お子さんもそれを隠したり，隠された者をますます知りたいという「興味本位」だけになったりします。性について，興味本位ではなく，まじめに，ざっくばらんに話せる親子関係ができるといいですね。

「未成年に販売して良いのでしょうか？」ですが，18歳未満の児童に，「成人指定のなされた書籍など」を販売するのは，大概の都道府県で青少年健全育成条例などにより禁じられています。（店舗によっては，18歳未満の児童が入ることすらできない所もあります。）販売した者は刑事処罰されることもあります。
実物を見てないので，何とも言えないのでしょうが，古本業者の値札がついていても，18歳以上の者が購入して捨ててあったり，人気のない所に隠していたりしたものを見つけたのかもしれません。

あまりにもお店の対応がいい加減でしたら，警察に話してみてはどうでしょう？
場合によっては，警察が指導をしますから，いくらか効果があると思いますよ。