法的には 民法 （期間の定めのない雇用の解約の申入れ） ６２７条 １ 当事者が雇用の期間を定めなかったときは、各当事者は、いつでも解約の申し入れをすることができる。この場合において、雇用は、解約の申し入れの日から２週間を経過することによって終了する。 となっており法律は契約や規約より優先されますから、職場の規定が３ヶ月であっても２週間前に通告すれば法的には雇用契約を解除することが可能です。 つまり、３ヶ月前というあなたの職場の規定に従うかは、あなたの判断で良いという事です。 次に申し出先ですが、まずは直属の上司（それが主任なら主任）に申し出るのが一般的ですが、人事権を持つ人との仕事上の距離が遠くないのであれば、人事権を持つ園長や理事長に直接申し出ても問題ないと思います。