「理由をただす」の「ただす」は、「質す」と書いて”不明確なところ、疑問に思うところを相手に質問してあきらかにする”ことですから、「理由をただす」は”理由の不明確なところ、疑問に思うところを質問してあきらかにする”という意味です。「質問」というより「尋問」といったほうがよいかもしれません。