外見上賃貸住宅に居住し家賃を支払っているだけ、とも見えてしまう状況です。 分割購入であるならばその旨がわかる契約を締結しておく必要があります。 しかも全額支払後に所有権が移転するのであれば、登記簿上何も記録がなされません。 現時点では人間関係が良好であり、好意で話が進んでいるようですが、あやふやなままで進めた場合、問題が発生した場合「話が違う」などとこじれますし、思わぬ損をすることも考えられます。 できるだけ明確にする手段の一つとしては、現時点で義父から質問者夫婦が売買してして所有権移転登記まで済ませることです。 その上で、売買代金相当額を義父から借りたという金銭消費貸借契約を行い、返済の担保として夫婦が購入した不動産に義父を抵当権者とする抵当権を設定することです。 あとは毎月決まった金額を義父へと返済し、返済の事実が明確になるよう書面を残しておく（領収書や銀行振込の書面など）ことです。 一般的な売買では売主から不動産を購入し、銀行からお金を借りて抵当権を設定しますが、この売主と銀行が義父になったという形態となるわけです。 なお、親子間売買は税務署が税金逃れ（贈与税逃れ）ではないかなどと目を付けやすい案件ですから、契約や実行に当たっては弁護士や税理士に事前に直接相談し、問題がない状態で契約を行うことをおすすめします。