まずYouTubeですが、YouTubeにアップロードされている動画すべてが合法とは限りません。 (1) 著作権者がみずからアップロードした動画 … OK (2) 著作権者ではない人がアップしたが、著作権者が「そういうアップの仕方ならいいよ」とあらかじめ独自に定めているガイドラインに従っているため、違反ではない動画 … OK (3) 著作権者ではない人がアップしていて、著作権者がそういうアップの仕方はいいと言っていないが、著作権者はその勝手なアップロードに気づいていないため、違法アップロードが放置状態になっている動画 この3種類があります。 あなたが自分の同人誌に記述したいその動画のリンク先が(3)ではないと確信できるなら、URLでもQRコードでも大丈夫です。 その動画が(1)(2)(3)どれなのか分からないなら、書かないほうがいいです。 その動画が合法な動画なのか違法動画なのか分からなくて、「合法だと思っていてQRコードを書いたが、後からそれが違法動画だと判明した」という場合、あなたが違法コンテンツへの誘導をしたという罪で裁かれるか？というと、「著作権者に見つからなければ大丈夫なんじゃないの」という気もしますが… そう判明した時、あなたも読者も、その本を読み返したときに悲しい気持ちになると思います。 なので(1)(2)の確証がないなら、そのリンクは書かないほうがいいと思います。