国内向けに売られている端末なら、どこで買っても端末自体に差異はないです。 違う点としては、支払いの方法や回数や額などです。 これは分割払いを使うかどうかでも変わるので、本当に場合によります。 私から言うと間違いが起こるかもしれないので、ご自身でよく調べてから買ってください。 あと、キャリアで買った場合、他のキャリアでは使えない・使いにくい場合があります。 メーカーで買うとそういったことがほぼ起こりませんので、キャリアを移行する可能性があるならそれもメリットだと思います。