メタ的な話をすると可変機のMS 、MAの区分けは「スタッフの気分次第」だったんです。 それを設定的は「メインとなる形態側にしよう」としただけ。 発進時の形態については、 重力下でガルダ等からの発進の場合、最初からMA形態を取るほうが、発進直後に失速して落ちたりしません。 地上の基地からの発進となると、機体によってはMS形態で発進したケースもあるでしょう。 無重力下では、失速や落下を考えなくて良いのでどちらでも良いですが、標準的な機体サイズであれば、艦の発進カタパルトを使えるので、MS 形態で発進して変形すれば良い。 大型でカタパルトが使えないなら、MA形態で自力で加速すれば良い。 まあ、これについてもメタ的な話をすると、発進シーンや変形シーンをバンクで使い回せるようにする為に「MS形態で発進」「変形」に分けたのかと。