診断書が出ている状態で病気休暇を取っているということですね。 病気休暇は確か６か月で、その後は休職（最長３年間）となるはずであり、どの期間で産前休暇に入るのかわかりませんが、出産予定日の６週前に産前休暇に入り、産後休暇（産後８週）、引き続いて育児休業（最長３年）と連続して取れるはずです。 途中で体調が良くなり出勤できるのであれば、妊娠中に勤務することも出来ると思います。 切迫早産などで自宅安静になり長期にわたる病気休暇のまま産休へ突入する人もいますので、病気が違うだけで特に問題ないと思います。 前の病名と違うので１月から３月に病気休暇を取っていた件は関係ないと思われます。