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shRNAとsiRNAの違いはなんですか??発現抑制などに違いはありますか??

kot********さん

2014/4/1609:46:55

shRNAとsiRNAの違いはなんですか??発現抑制などに違いはありますか??

shRNAとsiRNAの違いはなんですか??発現抑制などに違いはありますか??

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bid********さん

2014/4/1820:50:33

人工合成したRNAを使ってRNAi(ノックダウン)実験をする際、
(1) 人工合成したsiRNAとそのアンチセンス鎖RNAを
アニールさせて2本鎖にし、トランスフェクションする
(2) 1本鎖のRNAの内部に相補性があり、部分的にアニールして
ステム構造をつくるようなRNAを合成し、トランスフェクションする
という方法があります。後者は、1本鎖RNAが部分的にステムを
つくって短いヘアピン(short hairpin)構造になるので、
shRNAと呼ばれます。

人工合成したRNAを使うのではなく、プラスミドベクターや
ウイルスベクターを使って細胞内で転写されてsiRNAがつくられる
ようにする場合も、転写されたRNAがshort hairpin構造をつくるように
配列をデザインしますので、こちらもshRNA(ショートヘアピンRNA)
ができ、それがdicerによってプロセシングされてsiRNAになります。

質問した人からのコメント

2014/4/19 12:59:44

ありがとうございます(*ノωノ)⌒Y⌒Y⌒[\/]

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