大学受験のための学習ということなら、助動詞の理解と単語の暗記は両輪のようなものなので、どちらが優先とは言い難いですね…。 ただ、助動詞の方が覚えるべき量が圧倒的に少ないので、先に集中して覚えてしまうといいかもしれません。 実際の読解の中でその知識を「使う」練習も必要ですし。 漢文は古典文法を使って読むものなので、まずは古文の基礎を固める方がいいかと思います。 助動詞「しむ」や「る」「らる」が分かっていないと、漢文の使役形も受身形も理解するのが大変なので。