まず、つみたてNISAで月45000円は積立てできないはずです。何か勘違いされていないでしょうか？（MAX月33333円です） 特定口座で20万以上の利益が出なければ、税金はかからないのはおっしゃる通りです。特定口座には（源泉徴収アリ）と（源泉徴収ナシ）の２種類があります。源泉徴収アリを選択すると証券会社が勝手に税を引いてくれるので確定申告が不要になります。こちらがおすすめですね。 ただし、心配されているように20万以下の利益であってもかからないはずの税金を勝手に引かれてしまうデメリットはあります。 しかし、それって、最大でも２万円ですよ。どうでもいいレベルではないでしょうか。 それより、長期積立て投資なら20万以上の利益は想定したいですから、あまり悩む必要のない部分かとも考えますが。