いいえ。別に一回目の申請手数料が不要なのではなく、すでに証紙が購入済だと言うだけでしょう。試験も交付も、その場で毎回現金払い（証紙納付なら証紙払い）です。無料にはなりません。 交付手数料分の証紙がまだ未購入なら、交付手続き時に買う必要があります。 それにしても、県で随分と差が出来たようですね。私の住む福岡県では、普通自動車や普通二輪の試験手数料は1,750円で、交付手数料は2.050円です。