核弾頭を破壊した場合は起爆しない可能性が高いので電磁パルスは発生しません。 核分裂反応(核爆発)を起こすには反応を起こすための核物質を分けておき、爆薬などを使い一度に圧縮する必要がありますが、弾頭が迎撃され破壊された場合はこの反応のバランスが崩れ核爆発が起こりません。 また、起爆装置そのものを破壊した場合も爆発しません。 核爆発が起こらなければ電磁パルスは発生しません。