それは多分ホワイトノイズです。 動画から音声データだけを抜き出し、SoundEngine Freeのノイズサプレッサー等でホワイトノイズを除去した後、再び動画と合成してください。 ホワイトノイズが気になるということは、そうとう静かなシーンですよね。ビデオカメラはAGCで静かな場面だとゲインを目一杯上げてしまうのでホワイトノイズが気になるような録音になってしまいます。その場合は、オートではなくマニュアル録音してください。