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真核生物の16srRNAについて混乱しているので以下の認識で合っているか教えていただ...

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ID非公開さん

2019/1/2910:31:55

真核生物の16srRNAについて混乱しているので以下の認識で合っているか教えていただけないでしょうか。

・真核生物において、核ゲノムには18srRNA遺伝子が含まれ、ミトコンドリアDNAには16srRNA遺伝子が含まれている。

・16sと18sの塩基配列は全く異なり、16sのユニバーサルプライマーでは18sの領域は増えてこない。(逆も同じ)

・真核生物の種判別、系統樹作成等を行いたい場合、16sと18sどちらを使用しても可能。
(生物種にもよると思いますが。。)

よろしくお願いいたします。

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ベストアンサーに選ばれた回答

ple********さん

2019/1/3010:05:03

詳しくは知りませんが。

・真核生物において、核ゲノムには18srRNA遺伝子が含まれ、ミトコンドリアDNAには16srRNA遺伝子が含まれている。

>正しいです。補足すると植物の場合はさらに葉緑体にも16sRNA遺伝子が含まれます。

・16sと18sの塩基配列は全く異なり、16sのユニバーサルプライマーでは18sの領域は増えてこない。(逆も同じ)

>正しいです。16sと18sの配列は似ている部分もありますが、全体としてはかなり違うので16s用と18s用のユニバーサルプライマーが別々にあります。


・真核生物の種判別、系統樹作成等を行いたい場合、16sと18sどちらを使用しても可能。
(生物種にもよると思いますが。。)

>18sを主に使いますが、ミトコンドリアの16sも使われることがあります。また28sや18sと28sの間の配列(ITSといいます)も良く使われてます。ただし全生物の系統樹では、ミトコンドリアの16s遺伝子は真核生物ではなく原核生物の系統に入ります。

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    質問者

    ID非公開さん

    2019/2/415:48:31

    ご回答ありがとうございます。モヤモヤが晴れてすっきりしました。お礼が遅くなってしまい、申し訳ありませんでした。

    ところでまた新たな疑問が出てきてしまいました。。
    もし、真核生物に細菌が感染し、その感染した組織からDNA抽出、16sのPCRした場合はどうなるのでしょうか。
    両者とも増えてくるのでしょうか。それとも真核生物と原核生物では流石にユニバーサルプライマー配列が違うのでしょうか。

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質問した人からのコメント

2019/2/5 08:47:34

疑問に対する的確なご回答、本当にありがとうございました。
また、期限ギリギリに追加の質問してすみませんでした。これについてはまた別途質問させていただきます。

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