人事部に３年いましたが、実際そんなの出す人なんて私が関わった中ではいませんでしたね。 まずは直属の上司の話をして、そこから人事に話が来て、人事が用意した退職願に記入・捺印するって流れでした。 違いはないと思いますが、そういうのを出すって事は直属の上司と普段からちゃんと話が出来ない環境にあるんだと想像します。