ウィンドウキャプチャでマイクラのウィンドウキャプチャして、 OBSのソースでウィンドウキャプチャを右クリックして、 ポップアップメニューから「出力サイズ変更(ソースサイズ)」選べば、 ウィンドウモードでもマイクラの画面だけキャプチャーできると思いますよ。