サンドペーパー（紙やすり）が良いと思います。 透けて見えるくらいの薄い貝なら簡単に割れますので、なるべく負荷が掛からない方法の加工が望ましいです。どの程度カットしたいか解りませんが、サンドペーパーで端から削って行っても、それほど時間はかからないんじゃないかと思います。ペーパーの番手は#800番くらいかな・・#600番の方が削るのは早いですが、割れる危険も高いです。貝の強度によって決めてください。 できれば耐水のサンドペーパー（耐水ペーパー）を水に濡らして削ると、割れる危険性が少なくなります。