SONYのHDDと言うものは存在しません。 Blu-rayレコーダーのことだと思いますが、チャプターを切ると言うことは、単純に動作プログラムが記述されるだけです。 再生時にリモコンからのコマンドに応じて記述プログラム(チャプター位置へ移動)が実行されるだけです。 不要な部分のカットなども含め、元の録画素材には何の変化も加わることはありません。 プログラムが記述されるだけです。 但し、消去した動画に関してはデータが抹消されます。 このプログラムに従ってBlu-rayディスクなどに書き出しをすれば、初めてその結果が反映された映像が生成されます。