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ポリペプチドのPIの計算方法について教えてください。 こちらのサイトでhttp://...

go2********さん

2009/11/1700:58:33

ポリペプチドのPIの計算方法について教えてください。

こちらのサイトでhttp://kusuri-jouhou.com/creature1/protein.html
このペプチドのPIが6,1とされていますが、どうやって計算したのでしょうか??

pK値の表を見てもどの数値を使えば良いのかわかりません・・・

計算方法がわかる方よろしくお願いします。

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ベストアンサーに選ばれた回答

ari********さん

編集あり2009/11/1713:46:22

この場合、ペプチドが同数(2個)の酸性基(-COOH)と塩基性基(-NH2,グアニジン基)を持つから、
中央の2つのpKaである「pK2とpK3」の平均を求める事で等電点(pI)の近似値が得られます。

pl≒(pK2+pK3)/2=6.1

(pK1=3.8、pK2=4.5、pK3=7.7、pK4=12.0)

「シスチン」というアミノ酸の等電点の求め方と同じです。


正確には4次方程式:
2[H^+]^4+K1[H^+]^3-K1K2K3[H^+]-2K1K2K3K4=0
を解いて求めますが、近似値と殆ど同じ値になります。



※ 携帯からなので画像が小さくよく見えないので間違っているかも知れません。

質問した人からのコメント

2009/11/20 23:18:31

笑う BAを選ぶのが遅くなり申し訳ございません;;

理解できました!
ありがとうございました^^

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