薬師岳小屋は縦走路上にあるため、鳳凰小屋のように稜線からくだってまた登りかえすという手間ははぶけます。 ただ水については鳳凰小屋のほうが潤沢です。薬師岳小屋は天水にたよっているので水場はなく(非常時か有料ではわけてもらえますが、美味しくない)、手前の南御室小屋の水場で個人使用分の水を確保するように推奨されますね。 食事は薬師岳小屋のほうがよいでしょう、平日だとかなり空いてたりもしますし。 ただ鳳凰小屋との比較論なので、北アルプスあたりの山小屋ほどの期待はできませんが。 南御室小屋から水を余分に持つ手間をおしまないなら薬師岳小屋のほうがいいかもしれませんね。朝夕の劇的な光景、日が沈んでからの稜線からの夜景と星空、眼前に迫る白峰三山など、小屋から出ればすぐみれるので、景観を堪能するには優れた立地です。 翌日の行程は広河原までですかね？だとすると鳳凰小屋のほうがやや余裕ができますが、逼迫するほどの差は出ないと思います。往復するにしても、東側の麓に下るにしても無理のない範囲でしょう。 ご安全に楽しまれてください。